基礎醫學院是集教學、科研、學生管理等功能為一體的綜合性學院，其前身是成立于1978年的基礎醫學教學部，2002年更名為基礎醫學院。

　　基礎醫學院現有黨政辦公室、科教科、研究生科、學生科4個職能科室和6個學生工作辦公室；有人體解剖學、組織胚胎學、生理學、病理生理學、免疫學、病原生物學、細胞生物與遺傳學、生物化學與分子生物學、化學等9個教研室；有1個省級醫學基礎實驗教學示范中心、1個省級虛擬仿真實驗教學中心；有5個科研平臺和1個四川省腫瘤醫學國際科技合作基地；有四川省科普教育基地1個。

　基礎醫學院現有職工227人，其中專任教師209人，實驗技術人員18人。專任教師中正高級職稱占14%，副高級職稱占30%；博士（在崗66人）占32%，碩士占56%；有出國出境學習經歷的占10.11%；有碩士研究生導師43人（其中兼職碩導6人），兼職博士生導師3人。有教育部“長江學者”講座教授、四川省“百人計劃”人才、四川省有突出貢獻優秀專家、教育部新世紀優秀人才、省市學術與技術帶頭人及后備人選、四川省教學名師及優秀教師、省市勞模和“三八紅旗手”、瀘州市“酒城英才”等各級各類優秀人才67人次。