繼續教育學院依托上海中醫藥大學醫教研學科優勢和雄厚的師資力量，舉辦各類成人教育，是學校成人教育的專職辦學部門和管理機構。下設學歷教育中心、非學歷教育中心、醫學繼續教育項目管理中心、學院辦公室。

　　繼續教育目前設有夜大學專科、本科、專升本層次的中醫學、中藥學、中西醫臨床醫學、護理學、康復治療、營養、公共事業管理等專業；中藥學自學考試（專科段、本科段）。我校是中藥學專業（專科段、本科段）的成人高等學歷繼續教育自學考試主考學校。在學歷教育方面，形成了以專升本為主，兼顧高中起點本科和專科相結合的多層次辦學格局。

　　非學歷教育中心接受上海市衛計委、上海市食品藥品監督管理局、上海市勞動人事社會保障局等部門的委托，承擔了行業從業人員繼續醫學教育和執（從）業藥師、西醫學習中醫、護理人員中醫藥知識技能培訓班（基礎班、提高班）等繼續教育的培訓工作。以及面向社會（中醫藥專業技術人員、中醫藥愛好者和港澳臺同胞）舉辦多層次多形式的各類中醫藥知識技能培訓班、中醫中藥防病治病、保健養生知識普及和技能（崗位）培訓班，為社會培養了一大批高質量應用型的專門人才。

　　 學院擁有一支以大學校本部教師及附屬醫院臨床教師為主干的優秀教師隊伍，他們的教學經驗豐富，理論扎實，臨床診療水平高，教學效果好；擁有資源豐富的臨床教學基地和設施齊備的臨床技能實訓室。同時，繼續教育學院也擁有一支朝氣蓬勃、敬業崇德的高素質管理隊伍，在工作中不斷加強規章制度建設，不斷完善教學監控體系，對全過程教學進行嚴格的管理，保證良好的教學質量和社會聲譽。