1960年我校在全國中醫院校中最早建立針灸專業；1974年建立針灸推拿傷科專業；1978年建立針灸推拿系；1982年在全國最早實行針灸、推拿獨立招生，建立針灸系和推拿系；1998年成立針灸推拿學院。

　　 作為全國最早建立的針灸推拿本科及研究生教育基地，擁有國家中醫藥管理局重點學科、上海市教委重點學科的學院，秉承學校“不重其大重其優；不重其全重其特；不重其名重其實”的辦學理念，堅持“研究教學型、特色型、外向型”的辦學定位，為社會培養針灸推拿專業人才。

　　 學院擁有豐富的教學資源和文化底蘊，教學特色明顯。擁有國家級教學團隊，國家級精品課程、視頻公開課、資源共享課，上海市精品課程，上海市高校全英語示范課程，上海市外國留學生英語授課示范性課程；上海市教學名師；在國家級規劃教材主編方面，獲國家級規劃教材、上海市級優秀教材；獲上海市教學成果二等獎、三等獎。作為我校對外交流的重要窗口，每年都有教師赴東南亞、歐美等國家和地區講學交流以及醫療合作，接待國外學者和團體的訪問交流。

　　 學院堅持以高層次、多學科交叉結合的發展思路，積極與復旦大學、上海交通大學、中科院上海技術物理研究所、華山醫院手外科研究所以及美國馬里蘭大學、德國美因茲大學、香港大學、香港中文大學等國內外綜合性大學和科研院所合作，開展科學研究和人才培養的良性流動，不斷推動著教學科研水平的提高和學科建設的發展。在針灸經絡基礎、臨床研究和針灸推拿診療技術的客觀化、標準化研究等方面取得了較好成績，先后獲得多項國家教育部、衛生部、國家中醫藥管理局和上海市科技進步獎。

　　經過不斷建設和努力，已經形成符合自身發展規律和國際化發展趨勢的針灸推拿人才培養的體系，在學科建設、科研水平、人才隊伍建設等方面有了長足發展，處于全國同類專業的前列。