按照學校建設“國內、國際知名”教學研究型大學的要求，藥學院2006年8月由沈陽遷至大連。藥學院由搬遷大連的43人發展到現有教職工97人，其中教師72人，實驗技術人員15人，行政人員10人；具有博士學位41人，在讀博士13人；教授16人，副教授24人，博士生導師10人，碩士生導師24人；國務院政府特殊津貼獲得者2人。

　　藥學院現設有基礎化學、藥理學、中藥化學、藥用植物、中藥鑒定、中藥炮制、藥物分析、藥物制劑、制藥工程、食品科學與工程、綜合基礎等十一個教研室和一個實驗教學中心，藥學院還設有一個中藥研究所和分析測試中心。

藥學院擁有中藥學一級學科博士學位授權點和生藥學二級學科博士學位授權點以及生藥學、藥理學、中藥學3個碩士點，其中中藥學為一級學科碩士學位授權點。還擁有中藥學博士后科研流動站一個。中藥鑒定和中藥炮制學科是國家中醫藥管理局重點學科，是遼寧省優勢特色學科和高水平重點學科，中藥學和生藥學是遼寧省重點學科。

近年來，藥學院先后承擔國家重大攻關課題及國家中醫藥管理局課題十余項，包括國家“十一五”科技支撐計劃課題2項，其中賈天柱教授負責的“中藥飲片炮制技術及相關設備研究”是全國課題組的總牽頭人。正在承擔的各級各類科技課題共計42項，經費資助達1700多萬元，包括國家重大新藥創制候選藥物2項，國家973項目子課題1項，科技部行業專項1項，國家自然科學基金課題15項。

　　藥學院承擔并結題的國家“八五”科技攻關課題榮獲國家中醫藥管理局科技進步一等獎2項，國家科技進步三等獎1項；國家“九五”科技攻關項目獲國家科技進步二等獎3項；獲省科技進步獎多項。主編出版專著50余部，發表學術論文1200余篇，其中在美國、德國、日本等國際雜志上發表論文100余篇。

　　藥學院近年來國內外影響不斷擴大，先后組織召開過全國微量元素學術研討會、全國中藥鑒定及標本館學術會議等，多名優秀教師應邀到世界及全國各地做學術報告，我們還邀請海內外著名專家學者來我院講學，日本富山大學、日本歧阜藥科大學、德國波恩大學都有知名教授來我院做過高水平的學術報告。