昆明醫科大學藥學院暨云南省天然藥物藥理重點實驗室是云南省藥物學高新技術創新人才培養基地、云南省卓越藥學人才教育培養基地、云南省高校轉型發展試點學院。1986年獲藥理學碩士學位授予權，2011年獲藥學一級學科碩士學位授予權，2014年獲藥學碩士專業學位授予權，2018年獲藥學一級學科博士學位授予權。現有藥學、臨床藥學和藥物制劑3個本科專業。藥學于2010年獲國家級特色專業，2016年通過國家專業認證；臨床藥學于2016年獲云南省品牌專業。現為全國藥理學會理事單位、中國高等教育學會醫學教育專業委員會藥學教育研究會理事單位、云南省藥理學會理事長單位、云南省藥學會常務理事單位、云南省執業藥師協會常務理事單位、云南省化學化工學會常務理事單位。

　　學院圍繞立德樹人根本任務，積極開展黨建思想政治工作。迄今共招收本科學生（含留學生）2664人，畢業生平均就業率達96%。近五年培養碩士研究生（含留學生）180名、博士研究生10名。近年來，教工第三黨支部和學生第二黨支部代表學校先后參加全國高校“兩學一做”支部風采展示活動并獲表彰；教工三支部獲“云南省高校先進基層黨組織”稱號；學院團委獲“云南省五四紅旗團委”稱號；學院獲學校文明單位和優秀基層工會組織。

　　  現有教職工91人，其中“百千萬人才”國家級人選1人，獲教育部霍英東教育基金青年教師獎1人；云南省中青年學術和技術帶頭人5人、后備人選2人；具有博士學位33人、碩士學位47人；正高職16人、副高職30人；博導6人、碩導47人（其中外單位17人）；有國外留學經歷30余人。

　　  現有云南省天然藥物藥理重點實驗室、云南省丁健院士工作站、云南省陳凱先院士工作站、云南省滇美分子藥物國際合作研究基地、云南省藥物政策研究中心、云南省高校藥學重點實驗室、中國科學院上海藥物研究所-昆明醫科大學天然藥物研究聯合實驗室，以及云南省天然藥物藥理學研究創新團隊、云南省代謝性疾病藥物基礎研究創新團隊、云南省COPD防治藥物研發創新團隊等高水平人才培養和科技創新平臺。擁有教學實驗室面積10000㎡；實踐教學基地30家，其中昆明醫科大學-云南白藥集團股份有限公司實踐教學基地為國家級實踐教學基地。