昆明醫科大學法醫學院是全國最早設置法醫學專業的9所高校院系之一。1983年專業獲教育部批準籌建，1984年招生，1988年成立法醫學系，2002年成立法醫學院，2005年新增法學專業（醫事法學方向）。學院1996年批準為法醫學碩士學位授權點，2012年開始招收法醫學博士生。法醫學專業2005年獲云南省重點建設建設專業，2009年獲國家級特色專業，2019年獲云南省一流本科專業。學院現有國家級精品/資源共享課程3門，省級精品/一流本科課程4門，校級品牌課程12門。法醫學院是云南省研究生教育創新聯合培養基地、云南省人才培養模式創新實驗區，已成為云南省高等法醫學和醫事法學人才培養、科學研究和司法鑒定的中心。

　　 法醫學院每年招收本科生120名、研究生15名左右，已培養畢業法醫學本科生30屆近1500人，四年制法學本科生10屆600余人。現有在校本科生553人，碩士、博士研究生57人（含外籍留學生1人）。學院以“以人才培養為根本，立足云南，面向全國，服務政法，保障基層”為辦學思路，堅持“以培養高素質、能力強的應用型高級法醫學和醫事法學人才”為目標，始終堅持與公安聯合辦學模式，創建了具有鮮明特色的人才培養模式，2012年作為云南高校唯一模式入選入選教育部校院聯合培養人才20個典型案例。

　　學院下設法醫學系和法學系，設黨政辦公室、教學管理辦公室、學科科研及研究生管理辦公室、學生工作辦公室等四個行政管理機構，以及院黨委、團委、工會等三個黨群團組織。擁有7500余平方米的獨立辦學大樓，教學設施優良，擁有功能齊備，集教學、科研及司法鑒定服務一體的實驗室，包括法醫病理實驗室、法醫物證實驗室、DNA分析實驗室、法醫臨床學實驗室、毒物分析實驗室、法醫人類學實驗室、大鼠標準化行為實驗室、毒品濫用研究實驗室、模擬犯罪現場勘查實驗室、模擬法庭等。學院和省內外政法機關共建法醫專業實踐教學基地11個，法學專業實踐教學基地4個，形成了完善的專業實踐教學網絡。

　　學院師資優良，現有教職工47人，教授4人，副教授17人，有博士研究生導師4人，碩士研究生導師22人。法醫學教學團隊為云南省優秀教學團隊，云南省博士研究生導師團隊；法學教學團隊為校級優秀教學團隊。學院是云南省法醫學專業教指委主任委員單位，有國家教指委委員1人。團隊中有享受國務院特殊津貼專家1人、司法部新時代最美法律服務人1人、云南省教學名師1人、云南省卓越青年教師1人、云南省教學研究先進1人、云南省師德標兵1人，有云南省中青年學術技術帶頭人及后備4人，云南省十佳優秀司法鑒定工作者1人，昆明市中青年學術技術帶頭人及后備4人，校百名骨干教師3人，校學生最喜愛教師1人。此外，有國家級司法鑒定領域資質認定評審專家4人，CNAS評審員3人。

　　 法醫學院高度重視科研與學科發展。法醫學學科為昆明醫科大學重點建設學科，特色研究方向有毒品依賴機制、少數民族遺傳多態性、慢性運動性腦損傷等。法學學科為昆明醫科大學重點建設培育學科，主要研究領域包括醫患法律關系研究和司法鑒定法律制度研究等。學院目前已主持國家自然科學基金26項，國家重點研發計劃子課題1項，863計劃子課題2項，省廳級基金100余項，2019年作為主要成員獲批國家衛生健康委員會毒品依賴戒治重點實驗室。

　　 昆明醫科大學司法鑒定中心是由法醫學院負責管理、具有獨立法人資格的司法鑒定機構（許可證號:530101001），也是學院專業人才培養的重要平臺。中心前身為云南省衛生廳指定為“云南省醫療尸檢中心”組成單位（1999年），2001年正式成立，是經云南司法廳批準的云南首家司法鑒定機構，為云南省最早通過國家級CNAS認可（2009年）和國家級資質認定的鑒定機構（2014年），是司法部指定的全國司法鑒定人法醫轉崗培訓基地、云南省司法鑒定繼續教育基地，是全國司法鑒定先進集體， 2019年入選司法部公民非正常死亡法醫鑒定推薦機構，為云南省最具學術權威的司法鑒定機構。