醫學信息工程學院創辦于2003年4月，秉承“厚德敬業、誠信創新”的培養理念，以立德樹人鑄就教育之魂，致力于生物和醫藥信息化領域、IT行業的專業人才培養。

　　  擁有“計算機科學與技術”“醫學信息工程”“生物醫學工程”三個本科專業和“中醫藥信息學”二級學科碩士、博士點。其中，“計算機科學與技術”本科專業是廣東省級一流本科專業建設點、廣東省應用型人才培養示范專業；“中醫藥信息學”是國家中醫藥管理局重點學科，國家杰出青年名師擔任研究生導師；“中醫藥信息學”實驗教學示范中心是廣東省代謝性疾病中醫藥防治重點實驗室參與建設單位之一。

　　經過多年建設，中醫藥信息學學科已形成本科—碩士—博士完整的人才培養體系，醫工結合，多學科的深入融合創新的特色明顯，并基本形成醫工結合的跨學科人才培養模式及穩定的研究方向：基于大數據中醫藥臨床循證評價研究、中醫診療數字化研究、臨床醫學影像智能化診療、中醫藥數據挖掘與知識發現。本學科利用現代信息技術的知識來解決中醫藥領域中的問題，將為中醫藥的傳承和發展帶來新的機遇。

　　現有在校全日制本科及研究生共645人，已培養畢業生1872人。近年來，學生累計獲國際獎項4項，國家級30項，省級103項；本科生項目獲2019年第十六屆“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽二等獎；本科生在國際高端學術會議中發表8篇論文；學生科技項目獲國家級立項57項，省級67項；獲專利授權4項。學院重視“雙創”教育，組建PI團隊，成立大學生創新創業實踐中心，設立學生創新獎鼓勵學生創新創業實踐。