針灸學院源于1958年福建中醫學院成立時的針灸教研組。1988年1月，經福建省編制委員會批準成立骨傷針灸系，1989年獨立設置針灸推拿系。2010年5月針灸推拿系更名為針灸學院。

　　1982年開辦針灸學專業本科，學制五年。學院現有針灸推拿學、針灸推拿學(中醫美容特色選修模塊)專業，擁有博士和碩士學位授權點，目前在校本科生及國內外研究生1200余人。

　　學院師資力量雄厚，專業教師中博士化率達55.6%，擁有博、碩士生導師75人（含臨床導師）。

　　學院的針灸推拿學專業為國家級特色專業、福建省第一批一流本科專業，針灸學科、推拿學科為國家中醫藥管理局重點學科。《經絡腧穴學（雙語）》為國家教育部雙語示范課程，《經絡一點通》為國家級精品課程，《針灸學》和《刺法灸法學》為省級精品課程，《經絡養生與文化》為省級高校精品在線開放課程（已上線國家精品課程在線學習平臺），《針灸學》和《小兒推拿學》為省級線下一流本科課程。針推技能實踐教學中心為省級實驗教學示范中心建設單位，《針灸學》為省級教學團隊、省級專業綜合改革試點。

　　學院60多年的發展和成效，凝結了老一輩專家學者及全院教職員工的心血。在學校黨委領導下，學院將繼續秉持以提高人才培養質量為核心，以改革創新為動力，以強化師資隊伍建設為保障，大力加強內涵建設，努力實現教學、科研、醫療等方面的跨越式發展。