口腔醫學院創建于1984年3月，堅持立足福建、面向全國，開拓進取，“至精至微、厚德載物”，現已具有醫學學士—碩士—博士完整口腔醫學人才培養體系，逐步躋身國內同類口腔醫學院校先進行列。

　　學院現有口腔醫學一級學科博士學位授權點1個，口腔醫學專業學位博士學位授權點1個，口腔醫學一級學科碩士學位授權點1個，口腔醫學專業學位碩士學位授權點1個，2018年12月獲批口腔醫學博士后科研工作站。擁有1個國家級臨床重點專科（牙周病學），1個國家級虛擬仿真實驗教學項目基地；6個省級臨床重點專科（牙周病學、口腔種植學、口腔修復學、預防口腔醫學、牙體牙髓病學和口腔正畸學），1個省級口腔醫學疾病研究重點實驗室、1個省級口腔生物材料工程技術研究中心， 2個省級實驗教學中心（口腔醫學實驗教學中心、虛擬仿真實驗教學中心）和1個省高校優秀重點實驗室。

　　口腔醫學專業為首批國家級一流本科專業、福建省高校特色專業，口腔醫學學科為福建省一流學科建設高峰學科、福建省本科高校“專業綜合改革試點”，口腔臨床醫學為福建省高校重點學科。學院下設14個教研室，有專業教師141人，博士生導師10人，碩士生導師38人。擁有6支校級教學團隊。4門省級精品課程，1門省級精品線上線下混合式課程；2門校級精品課程，2門校級精品線上線下混合式課程。學院面向全國多個省（市）招生，目前，在讀本科生534人、博碩士研究生194人。學院最早開始招收港澳臺本科生，自1999年以來，共招收港澳臺本科生145人，目前在讀48人。

　　近五年，學院獲國家級、省部級、廳級及各類科研項目183項，獲批經費2044萬，其中國家級10項，省部級40項。獲得國家發明專利5項，實用新型專利15項。發表國際期刊論文（SCI）64篇。教師研究團隊獲福建醫學科技獎二等獎 1項，三等獎2項；福建省科學技術獎二等獎1項、三等獎2項。教學改革項目獲得福建省教學成果獎一等獎1項，二等獎2項。

　　學院堅持“請進來，走出去”原則，實行開放式辦學，注重對外交流。與美國哈佛大學、日本東北大學、日本長崎大學、奧地利維也納醫科大學、澳大利亞昆士蘭科技大學、瑞士蘇黎世大學、北京大學、武漢大學、第四軍醫大學等國內外著名口腔醫學院校建立密切合作關系。每年舉辦多場國家級、省級學術會議。聘請維也納醫科大學、昆士蘭科技大學、美國加州大學舊金山分校、香港大學的4位教授為“福建省閩江學者獎勵計劃”特聘教授或客座教授；聘請瑞士蘇黎世大學、美國加州大學舊金山分校的2位教授為福建醫科大學客座教授。注重教師培養，通過國家公派、校際交流合作等多種途徑，有計劃地選送優秀中青年骨干教師、優秀學生到國內外一流口腔院校進修、訪問和開展科研合作。連續六年與日本東北大學齒學院聯合申報櫻花科技計劃（中日青少年科技交流計劃項目）及短期留學項目，先后派出17名研究生赴日本東北大學參加國際交流營及一年期的合作交流。連續五年開展“醫帶醫路”暑期夏令營活動，邀請海內外口腔優秀學子來我院交流。