云南農業大學體育學院成立于2001年4月。前身為云南農業大學體育工作部，2001年3月26日經教育部和云南省教育廳批準，同意云南農業大學招收體育教育以及社會體育專業學生，學制四年。體育學院現有教職工38人，其中專職教師33人。教授3人、副教授5人、講師14人、助教11人。截至2007年共招收學生465人。學院負責全校一、二年級普通本科生公共體育課及學院專業課的教學工作，組織全校師生開展各種體育活動，同時負責學校對外的各種體育競賽訓練工作。

體育學院現有教學實驗樓一幢，內設教室、生理實驗室、運動解剖實驗室、資料室、辦公室等；有符合教育部規定的學生體制健康測試中心一個、標準田徑場一塊（含足球場）、標準游泳池（ 25米×50米）一個、體操房一幢、健身房150平米 、1000平米、 體育館一個、塑膠籃球場8塊、普通籃球場6塊、塑膠排球場5塊、塑膠網球場2塊、乒乓球桌24張、草坪小足球場一塊以及其他體育健身設備。運動場地面積達到5萬多平方米，學生人均擁有運動場地面積8平方米左右，保證了學生的體育教學及全校師生全民健身活動的開展。