學院現設有食品科學與工程、輕化工程（糧油深層開發與利用）、食品質量與安全、農產品貯藏與加工四個本科專業；具有食品科學學科一級博士后流動站，博士學位授予權，食品科學與工程學科具有一級學科碩士學位授予權。學院設有食品科學、農產品加工及貯藏工程、糧食油脂與植物蛋白工程、水產品加工及貯藏、發酵工程等五個二級碩士學位授予權的學科。其中食品科學學科為吉林省“十五”、“十一五”重點學科。學院下設食品科學、食品工程、輕化工程三個系，有畜產食品加工、農產品加工、發酵工程、糧油深加工、食品工程、食品安全六個教研室；學院設有農產品加工與與質量安全省級重點實驗室和食品工程研究中心。建有畜產食品加工工藝、糧油深加工工藝、農產品加工貯藏三個校內中試基地，以及6個實驗室。學院為中國畜產品加工研究會副理事長單位和團體會員單位，吉林省食品學會和釀酒協會團體會員單位。

　　食品科學與工程學院現有教職工52人，其中教師41人，有教授7人，副教授11人，講師22人，教師中具有博士學位14人，碩士學位23人。教師平均年齡35歲。多年來，先后選派25人次赴國外留學和進行學術交流。學院現有在校本科生1,600人，全日制博士、碩士研究生140人，專業碩士學位研究生58人。

　　多年以來，學院的學科建設和教學改革取得了豐碩成果。1997年在學院成立的同時，聯合省內外11家大中型食品企業本著“優勢互補、互惠互利、共同發展”的原則，在全國農業高校率先創建了校企聯合辦學董事會。學院董事會成立以來，在學科專業建設、師資隊伍建設、人才培養以及科研與產業開發等方面都取得了顯著的成績，辦學規模、辦學水平得到了明顯提高。學院董事會成員單位已經發展到24家，較好地保證了實踐教學和畢業生就業的需要。學院畢業生一次性就業率連續5年達100%。學院還十分重視課程建設和教材建設，有四門課程被評為省級優秀課程，共主編和參編各類教材40余部，其中主編全國統編教材和“十五”規劃教材16部。

　　學院注重學術交流，與日本、美國、韓國、俄羅斯、烏克蘭等國高等院校及科研院所建立了長期穩定的學術交流與技術合作關系，成功主辦了“畜產品加工研究會第三屆二次理事會議”，“第八屆全國高等農業院校食品科學與工程專業教學與學術研討會”等全國重大學術會議6次。

　　在國家振興東北等老工業基地戰略和發展農產品加工產業的大好形式下，吉林農業大學食品科學與工程學院將充分發揮學科優勢與辦學特色，抓住機遇，審時度勢，進一步集中精力，凝練方向，在加快學院的建設與發展的同時，加強與國內外相同學科領域的交流與合作，開拓進取，團結奮進，為國家和地方經濟建設做出更大的貢獻。