哈爾濱醫科大學藥學院始建于2001年，共組建了藥理、臨床藥理、生物制藥、藥劑、生藥、醫用物理學、有機化學、無機化學、藥物化學與天然藥物化學、藥物分析與分析化學10個教研室、 1個藥學實驗中心及7個研究機構。

　　學科建設

　　學科優勢

　　（1）團隊：現有中國工程院院士1人、973首席科學家1人、中華醫學會副會長1人、光華工程科技獎“青年獎”1人、全國百篇優秀博士論文獲得者1人、教育部新世紀人才3人、施維雅獎7人、龍江學者及省杰青9人等學科骨干。

　　（2）平臺：中俄106所醫藥大學聯盟主席單位，現有國家重點學科1個、國家科技創新群體1個、全國專業技術人才先進集體1個，及教育部重點實驗室、部省共建國家重點實驗室培育基地、國家發改委寒地心腦血管疾病藥物研發國家地方聯合工程實驗室等研究平臺。獲國家自然科學二等獎1項、教育部一等獎（教育部科技進步獎及中國高校科學技術獎）3項、中華醫學會一等獎1項、黑龍江省科學技術一等獎4項等105項獎勵。

　　方向設置

　　研究方向包括：

　　（1）重大心血管系統疾病發病和防治基礎研究；

　　（2）離子通道藥理學研究；

　　（3） 血管功能調節與高血壓發生機制與防治；

　　（4）藥物代謝與藥效學研究；

　　（5）天然藥物/生物藥物研發；

　　（6） 新型靶向制劑的研發。

　　師資力量

　　學院有專職教師85人，其中教授41人、副教授23人，博士導師11人、碩士導師37人、博士62人；教師隊伍中有多位具有國際影響力的學者，包括美國、澳大利亞、日本和俄羅斯著名大學的客座教授、榮譽博士；國家一級學會副理事長、國家二級學會主任委員各1人；中國工程院院士、973首席科學家、百千萬人才工程入選者、國家教學名師、全國百篇優博、十佳全國優秀科技工作者各1人、全國優秀科技工作者各1人；教育部新世紀優秀人才、省杰青各3人，龍江學者4 人。

　　科學研究

　　學院為藥學一級學科碩士點、藥學博士后科研流動站，博士后研究人員56人。藥學專業為教育部一類特色專業，臨床藥學專業為我國醫學院校唯一試辦專業。藥理學科為國家重點學科、二級學科博士點、博士學位授權點及博士后工作站；藥理學教研室被評為省級優秀教學團隊；生物制藥學科為黑龍江省重點學科；臨床藥物研究所為國家新藥臨床實驗研究中心、衛生部臨床藥理基地及博士后工作站。黑龍江省生物醫藥工程重點實驗室—省部共建國家重點實驗室培育基地設在學院。

　　學院為教育部和衛生部規劃教材主編單位，《藥理學》、《基礎化學》、《無機化學》、《醫用化學》、《醫用物理學》等八部教材為普通高等教育“十一五”規劃國家級教材；國家級精品課1門（藥理學），國家雙語教學示范課程1門（藥理學），省級精品課1門（基礎化學）；無機化學與物理化學教研室徐春祥教授主編的《基礎化學》、《有機化學》教材被評為“高等教育百門精品課程教材”精品項目.

　　學院各類課題近500項，其中國家自然基金132項，“973”首席項目1項，國家科技重大新藥創制項目1項 “973”子課題1項，“973”前期研究專項3項，“863”子課題2項，共獲得科研經費近1.7億元。共獲得各類成果獎勵94項，其中國家自然科學二等獎1項，教育部一等獎3項，省政府一等獎4項，光華工程科技獎1項,教育部二等獎2項，省政府二等獎17項，美國《高血壓》雜志Top論文獎1項等。共發表SCI收錄文章近600篇,，其中影響因子大于10的5篇（最高28.9），5-10的70余篇。在心律失常、離子通道及microRNA研究領域處于國際領先地位。首次發現microRNA、IKM3/M3受體等是心律失常及心源性猝死的重要調控分子，提出 “離子通道最佳靶點學說”，編入本科生、研究生國家規劃教材及首部《離子通道藥理學》專著中；闡明了As2O3臨床應用誘發長QT間期綜合征的機制，提出防治策略，解決臨床As2O3致死問題。申報專利90余項，授權30余項。自主研發了大明膠囊、粘連平等多種新藥，取得了重大經濟和社會效益；同時，為國內醫藥企業解決生產、研究中的瓶頸問題，間接經濟效益達百億元。