南方醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院是原第一軍醫(yī)大學(xué)轉(zhuǎn)制移交廣東省后，于 2005 年 6 月成立。2010 年 1 月始，學(xué)院全面試行學(xué)術(shù)負(fù)責(zé)人制（PI制），2014 年 9 月，成為南方醫(yī)科大學(xué)首批兩個(gè)“試點(diǎn)學(xué)院”之一。

　　學(xué)院秉承“創(chuàng)新引領(lǐng)發(fā)展，特色成就卓越”的理念，以特色內(nèi)涵建設(shè)、教學(xué)模式改革、多元協(xié)同創(chuàng)新發(fā)展以及體制機(jī)制創(chuàng)新“四位一體”的改革目標(biāo)為使命，更新理念，整合資源，匯聚人才，為躋身中國高校最優(yōu)秀的藥學(xué)院行列而奮斗。目前，學(xué)院設(shè)有 8 個(gè)創(chuàng)新群體，1 個(gè)本科教學(xué)工作部，4 個(gè)本科學(xué)系、9 個(gè)教學(xué)團(tuán)隊(duì)、3 個(gè)支撐中心。擁有藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士后科研流動(dòng)站，藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士、碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，藥學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)以及藥學(xué)（四年制）和臨床藥學(xué)（五年制）兩個(gè)本科專業(yè)。藥學(xué)專業(yè)為國家首批一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，廣東省名牌特色專業(yè)。學(xué)院建有全國藥學(xué)專業(yè)學(xué)位研究生培養(yǎng)示范基地、廣東省高等學(xué)校藥學(xué)化學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、廣東省藥學(xué)化學(xué)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心。藥學(xué)專業(yè)為廣東省名牌特色專業(yè)，2019 年獲批國家首批一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，2019 年 10 月以新標(biāo)準(zhǔn)首家通過藥學(xué)專業(yè)認(rèn)證。2017 年教育部第四輪學(xué)科評(píng)估中，藥學(xué)學(xué)科在參評(píng)的 105 所高校中排名第 21 位；2020 年 7 月學(xué)院藥理毒理學(xué)科進(jìn)入ESI排名全球前 0.3 %，2020年 5 月學(xué)院化學(xué)學(xué)科進(jìn)入ESI排名全球前 1 %。學(xué)院現(xiàn)有廣東省新藥篩選重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、廣東省新藥篩選國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、廣東省國際科技合作基地、廣東省特殊膳食用食品研究生物醫(yī)學(xué)創(chuàng)新平臺(tái)、廣東省保健食品新功能和安全性評(píng)價(jià)工程技術(shù)研究中心、廣州市新發(fā)病毒防治藥物研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、藥學(xué)實(shí)驗(yàn)中心和仿制藥一致性評(píng)價(jià)中心等重點(diǎn)科研平臺(tái)。

　　藥學(xué)院師資隊(duì)伍實(shí)力雄厚，朝氣蓬勃，結(jié)構(gòu)合理。現(xiàn)有正式在編人員 102 人，專任教師 81 人，以中青年教師為主體。其中：正高 32 人，副高 37 人，中級(jí) 12 人，博士生導(dǎo)師 23 人，碩士生導(dǎo)師 30 人，具有博士學(xué)位教師占專任教師總數(shù) 90.12 %，具有留學(xué)背景的教師占比 53.09 %。擁有國家杰出青年科學(xué)基金獲得者 1 人，科技部“中青年科技創(chuàng)新”領(lǐng)軍人才 1 人，“百千萬人才工程”國家級(jí)人選 2 人，國家重大人才工程青年學(xué)者 1 人，國家優(yōu)秀青年人才 2 人，教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才”1 人，享受政府特殊津貼者 2 人，“中國政府友誼獎(jiǎng)”獲得者 1 人，廣東省醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才 1 人，廣東省“珠江學(xué)者”特聘教授 1 人，廣東省“珠江學(xué)者”講座教授 2 人，廣東省“青年珠江學(xué)者”3 人，南粵優(yōu)秀教師 3 人，廣東省特支計(jì)劃“百千萬工程”領(lǐng)軍人才 2 人，廣東省特支計(jì)劃“百千萬工程”青年拔尖人才 2 人，廣東省“千百十工程”國家級(jí)培養(yǎng)對(duì) 2 人，廣東省“千百十工程”省級(jí)培養(yǎng)對(duì)象 2 人，廣東省“優(yōu)秀青年教師培養(yǎng)計(jì)劃”7 人，廣東省“珠江人才計(jì)劃”青年拔尖人才 2 人，廣州市“珠江科技新星”12 人，學(xué)校教學(xué)名師 5 人，學(xué)校本科教學(xué)優(yōu)秀教師 2 人，學(xué)校優(yōu)秀教師 10 人。有多名教師在國內(nèi)外學(xué)術(shù)團(tuán)體任職，包括中國藥理學(xué)會(huì)抗炎免疫藥理專業(yè)委員會(huì)主任委員、廣東省藥理學(xué)侯任理事長、教育部藥學(xué)專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)委員等。

　　近十年來，學(xué)院先后承擔(dān)了國家“973”計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、國家新藥創(chuàng)制重大科技專項(xiàng)、國家艾滋病重大科技專項(xiàng)、粵港關(guān)鍵領(lǐng)域重點(diǎn)突破招標(biāo)項(xiàng)目、教育部重大項(xiàng)目培育基金等國家、教育部、省市級(jí)課題 419 余項(xiàng)，研究經(jīng)費(fèi)達(dá) 2.3 億元。在Lancet, Nat Rev Microbiol, Blood, Angew Chem Int Ed、Adv Sci、Adv Materil、J Med Chem、Brit J Pharmacol等國際著名期刊上發(fā)表了SCI論文 700 余篇，申請(qǐng)和獲得了國家發(fā)明專利、國際PCT專利 200 余項(xiàng)，其中授權(quán)近 100 項(xiàng)。獲廣東省科技進(jìn)步二等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，三等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，參與獲得國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，教育部科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，廣東省科學(xué)技術(shù)一等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)科技一等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)。獲廣東省教學(xué)成果二等獎(jiǎng) 1 項(xiàng)，國際教育改革項(xiàng)目 3 項(xiàng)，各級(jí)教學(xué)研究項(xiàng)目 129 項(xiàng)，獲教學(xué)成果獎(jiǎng) 13 項(xiàng)。