華南師范大學體育科學學院成立于1999年12月，前身是創建于1951年9月的華南師范學院體育系，是國內成立最早的體育系之一。1963年合并到廣州體育學院，1968年合并回華南師范學院（當時為廣東師范學院）。1975年廣州體育學院復辦，華師大體育系再次合并。1982年華師大體育系再次復辦。

華南師范大學體育學科于1997年進入國家“九五”“211工程”重點建設學科行列，并于“十五”和“十一五”期間連續進入國家“211工程”重點學科建設，是國內唯一連續三期進入國家“211工程”重點學科建設的體育學科。

體育學科擁有體育學一級學科博士后科研流動站、體育學一級學科博士學位授權點、體育學一級學科碩士學位授權點、高校教師碩士學位授權點以及體育專業碩士學位授權點，是國內研究生培養規格最齊全的單位之一。

學院于1986年7月獲得體育理論碩士學位授權點， 1993年12月獲得運動生理學碩士學位授權點，1996年5月獲得體育教育訓練學碩士學位授權點，2003年7月獲得民族傳統體育學碩士學位授權點，2004年和2005年獲得高校體育碩士和體育專業碩士學位授予權。2000年獲得體育人文社會學博士學位授權點，2003年獲批運動人體科學博士學位授權點以及體育學博士后科研流動站，2005年獲批體育學一級學科博士學位授權點。