廈門大學是教育部直屬重點綜合性大學，是國家“985”、“211”工程重點建設的高校。廈門大學藥學院成立于2010年，是在原廈門大學生物醫學研究院、醫學院藥學系的基礎上，集聚生物醫藥研究的精干隊伍而成立的，一個薈聚海內外精英，培養社會應用人才，致力于自主知識產權原創性新藥研發的綜合型、創新型學院。

　　  學院瞄準國家人口與健康的重大需求，專注于癌癥等重大疾病的治療藥物原創性發現與創新性研究的重大科學前沿問題。以發展具有自主知識產權原創新藥為重點內容，致力于建立一個國家級“新藥發現與創制”科技創新平臺，形成綜合研究實力雄厚、獨具特色的集藥學研究、科技成果轉化應用和人才培養于一體的基地，并成為海峽西岸經濟區醫藥研究開發體系和現代醫藥生產體系的創新基地。

　　  學院具有多年本科、研究生教育培養經驗。藥學專業本科生招生始于2004年，并于2007年開始招收藥物化學和藥理學碩士研究生，以及化學生物學碩士和細胞生物學博士研究生；2008年起招收化學生物學博士研究生。學院目前設有藥學本科專業（設靶點藥物與藥理學、藥物化學與信息學、藥物制劑與轉化醫學工程學3個方向），擁有藥學一級學科碩士點（涵蓋藥物化學、藥劑學、藥理學、藥物分析學等學科），此外還可招收化學生物學專業的碩士和博士研究生；2015年開始招收轉化醫學學術型碩士和公共衛生專業型碩士。學院設立豐厚的本科、研究生獎學金，為碩士研究生提供全額學費。至2016年共有在校本科生320人、研究生201人。藥學學科獲得2015年福建省省級重點學科考核優秀。

　　  學院教學科研隊伍實力雄厚，整體囊括了一支以海內外高水平專家學者為核心、中青年骨干為中堅力量的一流人才團隊。學院由張曉坤教授擔任院長，教師隊伍100%具有博士學歷，三成以上在國（境）外獲得博士學位，82%以上有一年以上海外學術經歷。此外，學院還有一支包括諾貝爾獎獲得者、境內外知名院士、業界精英在內的三十多人的兼職教師隊伍。

　　  學院圍繞創新特色體系，建有多層次的教學科研平臺。現已有教育部“核受體腫瘤分子靶點與藥物開發”創新團隊、海洋活性物質功能、質量和安全性評價技術平臺（國家海洋局-廈門市）、南方海洋創新藥物研發平臺（國家海洋局“十三五”海洋經濟創新發展示范城市項目）、福建省新藥物靶點研究重點實驗室、廈門化學創新藥研發重大平臺、廈門市代謝性疾病重點實驗室、廈門市腫瘤細胞與分子診療重點實驗室、廈門市靶點新藥工程技術研究中心、廈門市林下中藥資源工程技術研究中心、廈門生物醫藥協同創新中心；參與建設兩岸關系和平發展協同創新中心（國家級）、細胞信號網絡協同創新中心（國家級）。并建有福建省藥學人才培養創新實驗區、福建省藥學實驗教學示范中心。與地方政府、醫藥企業、科研院所開展產學研合作，聯合共建17個校外教學實習實踐基地（校級4個），13個研發中心、成果轉化中心、技術服務中心，此外還建有1個院級對外公共服務平臺。

　　  學院立項有863課題、973子課題、國家基金重大研究計劃項目、“重大新藥創制”國家科技重大專項、國家國際科技合作專項、教育部科技研究重大項目等重要課題，取得了多項國際先進水平的科研成果。近年來，學院教師接連在《化學評論》（Chemical Reviews，影響因子40.197）、《細胞》（Cell，影響因子31.957）、《癌細胞》（Cancer Cell，影響因子25.888）、《自然醫學》（Nature Medicine，影響因子22.462）、《分子細胞》（Molecular Cell，影響因子15.280）等國際頂尖學術雜志上發表多篇學術論文，揭示癌癥、艾滋病、白血病等疾病的機理和潛在治療藥物分子，成果屢受《自然》（Nature）雜志旗下多種刊物高度評價及關注，深具重大的科研價值和廣闊的應用前景。學院瞄準國家人口與健康的需求，專注于癌癥等多種重大疾病的前沿科研，已產出了一批具有鮮明自主創新特色的科研成果，研發的原創性治療藥物、治療方法、診斷試劑和疫苗等系列成果轉化應用于臨床；原創抗癌靶點藥物K-80003獲得美國FDA臨床實驗許可批件，開展晚期結直腸癌臨床測試，有望產生擁有自主知識產權的一類新藥。

　　  學院與國內外科研院校、大型醫藥企業和地方政府緊密聯系，開展多層次合作。學院與美國桑福德-伯納姆-普利貝斯醫學研究所（Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute）、新加坡分子與細胞生物學研究院（Institute of Molecular and Cell Biology, Singapore）、美國辛辛那提大學藥學院（College of Pharmacy, University of Cincinnati）、美國加州大學伯克利分校（University of California, Berkeley）、英國紐卡斯爾大學生物醫學科學院（School of Biomedical Sciences, Newcastle University）、臺北醫學大學藥學院等境外院校開展密切的教學、科研合作與交流，輸送學生出國長期或短期留學、交流，聯合培養國際型拔尖人才。

　　  學院位于廈門大學翔安新校區，建有一萬五千平方米的藥學院大樓，配備國際水準的尖端儀器設備和高等級實驗室，綜合辦學條件優越，能夠滿足本、碩、博多層次的教學和科研需求。學院立足海西、面向國際，努力建設成為我國重要的自主創新藥物研發中心與專業人才培養基地、海峽西岸經濟區生物醫藥產業創新與產業化動力源頭。