基礎醫學院發端于1926年成立于上海的東南醫科大學（安徽醫科大學前身）的若干學科，后經半個世紀的發展壯大， 1976年學校整合人體解剖學、藥理學、生物化學等若干學科（教研室），設立基礎部，2000年6月正式更名為基礎醫學院。

　　學院擁有一支學科、學源、學歷、職稱結構較為合理，勤政廉政、愛崗敬業、樂于奉獻、專業精湛、樂教善教的教職工隊伍。學院現有在職教職工272人，其中專任教師197人（包括教授43人、副教授106人），實驗技術人員60人（包括高級實驗師11人，校聘副研究員4人）；目前已取得博士學位的教職工154人；博士生導師30人，碩士生導師104人。擁有二級教授3人、全國優秀教師2人、省級勞動模范6人、省級教學名師8人、省級教壇新秀12人。曾獲得全國模范教師、全國“三八紅旗手”、省級優秀共產黨員、省先進工作者、江淮十大女杰、省“三八紅旗手”、省十佳女教育工作者各1人次。

　　學院以二級學科為基本單位，下設12個教研室（病理解剖學、病理生理學、生物化學與分子生物學、生理學、藥理學、組織胚胎學、微生物學、寄生蟲學、免疫學、化學、人體解剖學、核醫學）和2個課程組(基礎醫學概論與神經生物)；3個教學實驗中心（形態、機能、病原與免疫）和2個科研實驗平臺（綜合實驗室和P2動物實驗室）。另設有9個研究所（中心）：基礎醫學研究所、天然藥物研究所、生物藥物研究所、神經生物學研究所、臨床病毒研究所、人獸共患病研究所、放射醫學研究所、干細胞研究所和過敏與免疫研究中心。

　　學院現有國家級教學示范中心2個(基礎醫學虛擬仿真實驗教學中心和基礎醫學實驗教學示范中心)、省級重點學科4個、省部級重點實驗室4個，另有省級科技公共服務平臺、省級領軍人才團隊以及省高校科研創新平臺團隊各1個；有博士學位授權一級學科點2個（基礎醫學、藥學），博士學位授權二級學科點9個，碩士學位授權二級學科點16個（含專業學位授權點1個），在讀博士55人，在讀碩士452人。現有兩個本科招生專業（基礎醫學與放射醫學），其中基礎醫學專業2019年恢復招生, 放射醫學專業2020年開始招生。

　　近年來，學院涌現出一大批在教學、科研一線上做出優異成績的突出人才，2人入選“教育部新世紀優秀人才支持計劃”；1人獲得霍英東教育基金會高等院校青年教師基金；省學術技術帶頭人9人，省學術技術帶頭人后備人選24人；2人入選安徽省“特支計劃”；皖江學者特聘教授和青年皖江學者各2人；4人入選安徽省高校“優秀人才計劃”拔尖人才；12人入選省高校學科帶頭人培養對象；3人獲安徽省杰出青年基金，4人獲安徽省優秀青年基金；7人入選安徽省高校學科(專業)拔尖人才學術資助項目，8人入選安徽省高校優秀中青年骨干人才國內外訪學研修項目，11人入選安徽省高校優秀青年人才支持計劃項目。1991年以來，先后有49人享受國務院或省政府特殊津貼。

　　近三年來，學院新增省級以上教學研究項目39項（包括國家級示范性虛擬仿真實驗教學項目1項、教育部高等教育司產學合作協同育人項目2項），省級教學成果獎二等獎1項、三等獎3項。新增省級以上科研項目127項（包括國家自然科學基金項目58項）；獲得安徽省科學技術獎一等獎1項、二等獎和三等獎各2項；三年來學院教師以第一作者或通訊作者發表SCI收錄論文共計325篇，42篇論文影響因子大于5.0，已獲得國家發明專利10項。

　　基礎醫學院黨委下設17個黨支部，現有黨員255名。教職工158名，其中正式黨員157名，預備黨員1名。研究生黨員97名，其中正式黨員83名，預備黨員14名。教職工黨員中博士91人，碩士48人；教授17人，副教授55人。

　　面向未來，基礎醫學院始終把人才培養、科學研究、社會服務、文化傳承和創新、國際交流與合作貫穿到辦院興院、立德樹人的全過程，努力為實現建設高水平醫科大學的大擔當、培育百千萬良醫的大責任和服務人民群眾的大情懷的“安醫大發展之夢”貢獻自己的力量與才智！