安徽農業大學植物保護學院是安徽農業大學的二級學院，是安徽省病理學會和安徽省昆蟲學會理事長單位。

　　學院的前身是1960年設于原農學系的植物保護專業，1973年獨立建系。學院先后創設農業環境保護專業（環境工程專業）、應用微生物專業（生物技術專業）、環境科學專業、生態學專業、動植物檢疫專業。2004年經學校院系、學科調整后更名為植物保護學院。

　　據2020年6月學院官網顯示，學院設有3個系，開辦2個本科專業；擁有1個一級學科博士點、3個二級學科博士點、1個一級學科碩士點、3個二級學科碩士點；有教職工57人，共培養博士和碩士畢業生500余人、本專科畢業生6000余人。