2000年，在中國(guó)工程院院士沈寅初教授的倡議下，浙江工業(yè)大學(xué)藥學(xué)院開(kāi)始組建并于2001年11月28日正式掛牌成立。2013年，依托學(xué)院為主體申報(bào)的“長(zhǎng)三角綠色制藥協(xié)同創(chuàng)新中心”入選首批國(guó)家“2011計(jì)劃”。

學(xué)院以“天人合一，循理精煉”為院訓(xùn)，以建設(shè)區(qū)域特色鮮明的應(yīng)用研究型學(xué)院為目標(biāo)，堅(jiān)持特色發(fā)展、協(xié)調(diào)發(fā)展、國(guó)際化發(fā)展，在隊(duì)伍建設(shè)、人才培養(yǎng)、學(xué)科建設(shè)、科學(xué)研究、社會(huì)服務(wù)等諸方面實(shí)現(xiàn)了令人矚目的發(fā)展。

學(xué)院下設(shè)研究所10個(gè)，擁有專任教師108人，其中正高職稱教師37人，副高職稱教師45人，具有博士學(xué)位教師占專任教師的78.7%；教育部“長(zhǎng)江學(xué)者特聘教授”1人，享受國(guó)務(wù)院政府特殊津貼2人，浙江省特級(jí)專家1人，浙江省有突出貢獻(xiàn)中青年專家1人，教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”1人，“錢江學(xué)者”特聘教授2人，浙江省高校中青年學(xué)科帶頭人7人，浙江省“新世紀(jì)151人才工程”28人。

學(xué)院擁有“藥學(xué)”省重中之重一級(jí)學(xué)科1個(gè)，“中藥學(xué)”、“化學(xué)生物學(xué)”省重點(diǎn)學(xué)科2個(gè)。2015年12月，藥學(xué)學(xué)科入選浙江省一流學(xué)科（A類）。學(xué)院擁有藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士授予權(quán)，下設(shè)藥物化學(xué)、藥劑學(xué)、藥理學(xué)、天然藥物學(xué)、藥物分析、微生物與生化藥學(xué)、化學(xué)生物學(xué)等七個(gè)學(xué)科方向，擁有制藥工程、藥學(xué)專業(yè)學(xué)位授予權(quán)；擁有制藥工程、藥物制劑、藥學(xué)、中藥學(xué)、生物制藥等五個(gè)本科專業(yè)，其中制藥工程為國(guó)家級(jí)特色專業(yè)、浙江省優(yōu)勢(shì)專業(yè)，并通過(guò)教育部全國(guó)工程教育專業(yè)認(rèn)證；藥物制劑為浙江省新興特色專業(yè)。

學(xué)院擁有國(guó)家化學(xué)原料藥合成工程技術(shù)研究中心、綠色化學(xué)制藥國(guó)家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室、綠色制藥技術(shù)與裝備教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、浙江省綠色制藥協(xié)同創(chuàng)新中心、浙江省新藥創(chuàng)制科技服務(wù)平臺(tái)、浙江省制藥科技創(chuàng)新基地等科研平臺(tái)。近年來(lái)承擔(dān)國(guó)家級(jí)及省部級(jí)科研項(xiàng)目150余項(xiàng)，獲國(guó)家技術(shù)發(fā)明二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，中國(guó)石油和化學(xué)工業(yè)協(xié)會(huì)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)4項(xiàng)，其他省部級(jí)科技獎(jiǎng)30余項(xiàng)，發(fā)表三大索引學(xué)術(shù)論文600余篇，出版專著3部，授權(quán)發(fā)明專利400余項(xiàng)。