第一臨床醫學院起源于1934年創建的江蘇省立醫政學院（南京醫科大學前身）醫科,后改稱醫療系，1994年在原南京醫學院臨床醫學系基礎上正式組建命名。

　　學院設在南京醫科大學第一附屬醫院（江蘇省人民醫院），與醫院實行一體化管理，下設6個學系、43個教研室。有臨床醫學和特種醫學2個一級學科博士學位授權點和相應的博士后科研流動站，其中臨床醫學涵蓋29個二、三級臨床學科。目前學院擁有國家級重點學科1個（心血管病學），江蘇高校優勢學科1個（臨床醫學）；國家重點臨床專科18個；國家重點實驗室1個（生殖醫學臨床部分），衛生部重點實驗室1個（活體肝臟移植），江蘇省臨床醫學研究中心5個,江蘇省“科教強衛”工程臨床醫學中心2個、臨床醫學中心建設單位2個以及醫學重點學科12個。

　　學院擁有臨床教師1885人，其中專任教師1145人。現有教授146人、副教授295人，博士生導師128人、碩士生導師332人。有中國工程院院士1人，國家“百千萬人才工程”人選1人，國家“優秀青年科學基金”獲得者2人，國家“有突出貢獻專家”5人，享受政府特殊津貼專家55人，獲教育部首批“全國高校黃大年式教師團隊1個”；有省“創新創業”團隊4個、高層次引進人才5人，省“特聘教授”2人、“特聘醫學專家”3人，省“杰出青年科學基金”獲得者1人、“優秀青年科學基金”獲得者3人，省“333工程”高層次培養對象158人次，省“科教強衛工程”創新團隊12個、杰出人才4人、領軍人才12人及重點人才33人，省“青藍工程”培養對象28人。

　　學院開設臨床醫學和醫學檢驗技術兩個專業，臨床醫學先后被遴選為國家特色專業建設點、省高等學校臨床醫學類重點專業、江蘇高校品牌專業建設項目，醫學檢驗為江蘇省特色專業。現有國家級大學生校外實踐教育基地1個、江蘇省實驗教學示范中心4個，省級精品課程2門、省級精品教材2部、省“十三五”重點教材立項2部。