歷史沿革：應用氣象學院的前身是農業氣象學系，成立于1960年，由我國著名農業氣象學家馮秀藻先生創建。1989年更名為應用氣 象學系，氣候學專業同時加入；2002年大氣物理學與大氣環境專業、2004年農業資源與環境專業相繼成立。2006年8月成立應用氣象學院，2014年生態學專業加 入。1978年獲得農業氣象學學士和碩士學位授予權，1988年獲得應用氣象學碩士學位授予權，2003年獲得應用氣象學博士學位授予權，2009年獲得城市氣象學 碩、博士學位授予權，2012年獲得生物學碩士學位授予權，擁有應用氣象學博士后科研流動站。所在一級學科大氣科學是國家級重點學科、江蘇省一級重點學 科、江蘇省高校優勢學科，2012年在教育部第三輪學科評估中綜合排名位列全國第一。學院是中國氣象學會農業氣象與生態學委員會主任委員單位，是學校國 際化水平領先的學院。

　　專業設置：學院現設有應用氣象學（含公共氣象服務方向）、生態學、農業資源與環境三個本科專業，應用氣象學、生態學、農業資源與環境三個學術型碩士學位授權點和農業專業碩士學位授權點，應用氣象學及環境生態學兩個二級博士學位授權點。

　　師資隊伍：學院擁有一支年富力強、學歷與職稱結構合理、綜合素質高的師資隊伍。現有專任教師81人，其中教授27人、副教授28 人，專任教師博士化率達到100%、國際化率（一年以上出國）超過60%。擁有中組部“千人計劃”、“青年千人”、江蘇省“雙創計劃”、江蘇省“外專計劃”、江蘇省“特聘教授”“三三三”工程、“青藍工程”以及 “六大人才高峰”等高層次人才31人。

　　科學研究：學院擁有教育部“陸地碳水循環與氣候變化”科技創新團隊、江蘇省“人類活動的環境效應”雙創引進團隊、江蘇省高 校“農業與生態環境氣象”優秀科技創新團隊。新建有“城市大氣環境”、“土壤環境”、“智慧氣象”等科技創新團隊。擁有江蘇省“農業氣象重點實驗室 ”，與耶魯大學聯合組建了“耶魯大學-南京信息工程大學大氣環境中心”，建成了國際合作“生態氣象環境研究中心”，參與建設教育部“氣候與環境變化國 際合作聯合實驗室”、江蘇省“氣象災害預報預警與評估”和“大氣環境與裝備技術”協同創新中心。

　　學院已形成作物氣象、設施氣象、陸地碳水循環與氣候變化、城市大氣環境、土壤環境、智慧氣象等相對穩定、優勢特色明顯的六個主要研究方向。 近三年，年均承擔國家級科研項目20項以上，縱向項目到賬科研經費年均1000萬元以上。年均發表SCI論文30多篇、申請專利20余項，研究成果在《Nature》、 《BAMS》等國際著名刊物發表并被選為亮點、封面文章。科研成果豐碩，先后獲得國家科技進步特等獎1項，一、二、三等獎各1項，全國科學大會獎1項，省部 級科技進步獎30項。

　　教學水平：應用氣象學專業2006年獲批為江蘇省首批特色專業，2008年獲批為國家特色專業建設點和江蘇省品牌專業建設點，2012 年獲批為江蘇省重點專業；生態學專業2008年獲批為江蘇省特色專業建設點。學院建有中國氣象局一級農業氣象試驗站、江蘇省應用氣象實驗教學示范中心、 江蘇省高校應用氣象產學研人才培養模式創新基地、南京市應用氣象科普教育基地等教學實驗平臺，共建教育部“大氣科學與環境氣象實驗教學中心”、“大氣科學與氣象信息虛擬仿真實驗 教學中心”。“農業氣象學”、“氣候資源學”、“微氣象學”、“應用氣象學方法”等為省部級精品教材和精品課程。近五年獲得江蘇省教學成果特等獎1項 、一等獎2項、二等獎多項。學院還承擔了世界氣象組織區域培訓中心農業氣象學國際教育和培訓任務。學校受教育部大氣科學教學指導委員會委托制定“應用 氣象學專業國家教學質量標準”。另外，應用氣象學專業連續十多年為A++專業，在全國高校同類專業中排名第一（五星級專業）。

　　人才培養：成立50多年來，學院秉承“厚基礎、強實踐”的人才培養理念，堅持理論與實踐相結合，為世界、國家和地方氣象事業 輸送了大量的優秀人才。中國科學院“百人計劃”于強、黃耀研究員，中國氣象局 沈曉農副局長等均為學院杰出的畢業生代表。多年以來，學院本科生就業率均達到100%，高質量就業率穩定在97%以上，研究生升學率45%左右。學院已成功舉 辦了32期世界氣象組織（WMO）國際農業氣象培訓班，為亞太地區、非洲、中東、拉丁美洲和東歐等119個國家和地區培訓了800多名學員，受到了世界氣象組織 （WMO）及相關國家和地區政府的高度評價。