海洋科學(xué)與工程學(xué)院成立于2018年4月，通過(guò)整合地理科學(xué)學(xué)院海洋科學(xué)系和生命科學(xué)學(xué)院水產(chǎn)系成立。

　　海洋科學(xué)的歷史可上溯至金陵女子大學(xué)時(shí)期，中國(guó)第一位女海洋學(xué)家，被譽(yù)為中國(guó)“海的女兒”的劉恩蘭教授和同事們一起創(chuàng)辦了地理系，為海洋學(xué)科的萌芽和發(fā)展打下了基礎(chǔ)。上世紀(jì)八九十年代以來(lái)，劉澤純、謝志仁、張忍順等教授相繼開展了淤泥質(zhì)海岸與岸外輻射沙洲岸灘演變研究、江蘇海岸帶調(diào)查、江蘇污染基線調(diào)查、潮波系統(tǒng)演化及海面變化過(guò)程與趨勢(shì)等方面的研究工作，形成了以海岸帶資源開發(fā)與管理、海洋信息技術(shù)研究為特色的海洋學(xué)科研究隊(duì)伍和研究方向。在科研的反哺下，科研優(yōu)勢(shì)不斷轉(zhuǎn)化為教學(xué)優(yōu)勢(shì)，2000年在地理學(xué)一級(jí)學(xué)科下設(shè)置海洋地理學(xué)碩士點(diǎn)，2002年設(shè)置海洋地理學(xué)博士點(diǎn)，2010年獲批海洋資源開發(fā)技術(shù)本科專業(yè)，2018年獲批海洋科學(xué)一級(jí)碩士點(diǎn)，2020年獲批海洋資源與環(huán)境本科專業(yè)。2017年海洋學(xué)科作為學(xué)科群成員進(jìn)入地理學(xué)一流學(xué)科建設(shè)。

　　水產(chǎn)學(xué)科的起源與江蘇省特色水產(chǎn)養(yǎng)殖品種資源（長(zhǎng)江三鮮-暗紋東方鲀）挖掘與利用密不可分。1996年為解決江蘇暗紋東方鲀資源化利用，南京師范大學(xué)聯(lián)合當(dāng)時(shí)的江蘇省水產(chǎn)局、江蘇省淡水水產(chǎn)研究所和江蘇中洋集團(tuán)科技攻關(guān)，水產(chǎn)學(xué)科就此起步并得到快速發(fā)展，并于1996年獲批水產(chǎn)養(yǎng)殖碩士點(diǎn)，2006年獲水產(chǎn)一級(jí)學(xué)科碩士授予權(quán)。水產(chǎn)學(xué)科是動(dòng)物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科、江蘇省優(yōu)勢(shì)特色學(xué)科和江蘇省生物學(xué)品牌專業(yè)支撐學(xué)科之一，是江蘇省“水生甲殼動(dòng)物病害重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”和“水產(chǎn)生物餌料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”學(xué)科基礎(chǔ)，是南京師范大學(xué)十三五校級(jí)重點(diǎn)學(xué)科，也是南師大農(nóng)學(xué)學(xué)科、動(dòng)物學(xué)與植物學(xué)和環(huán)境科學(xué)進(jìn)入ESI 1%的主要依托學(xué)科。經(jīng)20余年建設(shè)，圍繞水產(chǎn)生物餌料與營(yíng)養(yǎng)、甲殼動(dòng)物病害防治和特色魚類資源化技術(shù)，形成了水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)、水產(chǎn)動(dòng)物醫(yī)學(xué)和漁業(yè)資源與環(huán)境三個(gè)穩(wěn)定的學(xué)科方向。