適應21世紀生命科學的迅猛發展，旨在培養從事生命科學領域研究、教學及管理的創新型和復合型高層次人才，南京農業大學于2002年10月20日整合植物學、微生物學、生物化學與分子生物學、動物學四個學科正式成立生命科學學院。目前生命科學學院包含植物生物學系、微生物學系、生物化學與分子生物學系、動物生物學系4個學系和生物學實驗教學中心/生命科學實驗中心/國家級農業生物學虛擬仿真實驗教學中心。學院設有國家理科基礎科學研究與教學人才培養基地、國家生命科學與技術人才培養基地2個基地、生物科學（國家一流本科專業、國家特色專業）和生物技術（江蘇省品牌專業）二個本科專業。

　　  學院擁有較為雄厚的教學和科研師資力量。目前全院教職員工129人，專任教師97人，其中教授46人，副教授42人，博士生導師46人，碩士生導師79人，96%的專任教師具有博士學位，43%教師具有海外1年以上訪學經歷。學院擁有國家“杰出青年科學基金”獲得者3人、國家級教學名師 1人、享受“國家政府特殊津貼”在職教授2人、教育部“新世紀百千萬人才工程”1人、江蘇省“333”第二層次人才3人，獲“高校青年教師獎”1人、國家“優秀青年科學基金”獲得者1人、教育部新世紀優秀人才 7人、農業部崗位科學家2人、江蘇省“杰出青年科學基金”獲得者3人，其他省部級人才10余人。

　　  學院建有農業農村部農業環境微生物學重點實驗室、江蘇省雜草控制工程技術研究中心等多個省部級科研平臺。曾獲得國家科技進步二等獎、教育部自然科學二等獎、教育部科技進步獎等科研獎勵多項。“農藥殘留微生物降解菌劑”獲國家級重點新產品；“生物除草劑”系列產品已申報多個專利并產業化應用；氫氣在農業中應用獲法國液化空氣獎。五年來，在Science，PNAS，Nature Plants, Nature Communication, The Plant Cell, ISME J, Journal of Cell Biology, PLoS Genetics, The Plant Journal, Plant Physiology, Molecular Microbiology, Environmental Microbiology等雜志上發表SCI論文658篇，為南京農業大學 “生物和生物化學”、“微生物學”、“植物與動物學”和“環境科學與生態學”等學科進入ESI前百分之一或前千分之一做出重要貢獻。

　　   學院擁有一流儀器設備平臺，生命科學實驗中心是國家“211”工程重點建設的科研共享平臺，中心建有四個實驗技術平臺：顯微影像解析技術平臺、基因組學與蛋白質組學研究技術平臺、代謝組學研究技術平臺、發酵工程實驗技術平臺。擁有活細胞激光共聚焦顯微鏡、高分辨軌道阱質譜儀、液質聯用儀、掃描電鏡、投射電鏡、超高速離心機等各類大中型儀器設備四十多臺（套），儀器設備總價值超5000萬元。