南京航空航天大學經濟與管理學院，一直重視工商管理人才培養。早在上世紀80年代初，就受航空部委托，在系統內開展了不同類型的工商、工程管理教育培訓。
1999年與澳大利亞南澳大學合作成功舉辦MBA班。2001年率先在中航工業開展MBA相關教育，受到業界好評，被國家重點國防企業，如中國航空工業總公司部分直屬集團公司、航天科工部分直屬集團公司等，以及民航企業，如南方航空公司、東方航空、中國國際航空公司等指定為高端人才培養基地。
南航MBA教育項目于2005年申報并獲得試辦資格， 2006年春開始面向社會招收 MBA學生，2009年通過合格評估，正式取得MBA教育項目辦學資格。在全國MBA教育指導委員會的正確指導和學校的大力支持下，南航MBA辦學水平不斷提高、規模不斷壯大。據統計， 2011-2018年連續八年報名人數和實際招生人數名列第五批和第六批32所院校的前列。經過十年的發展，MBA項目從招生錄取、教學管理、學位管理、學生服務，到師資建設、質量管控、案例庫建設等都制定了一系列政策和激勵措施，項目在社會上的影響力與美譽度不斷擴大。截至目前，已累計招收MBA學員2693名，大部分畢業生成長為所在單位的中堅力量，部分畢業生走向了主要領導崗位，成為高層管理者。

南航MBA項目嚴格按照國務院學位辦和MBA教學指導委員會對MBA項目的招生、教學、教務、論文與職業發展的相關要求，南航MBA教育中心按照經濟與管理學院的行政工作要求，執行學院與研究生院的業務管理，學院專門成立了“MBA質量管理委員會”對MBA項目的培養質量進行監控。

招生與品牌推廣辦公室：負責落實學校的MBA招生計劃及新生入學工作，包含招生宣傳崗、外聯崗和運營管理崗。其中，招生宣傳崗的主要職責有：執行和落實學校MBA招生計劃，廣告宣傳南京航空航天大學MBA項目，開拓南京航空航天大學MBA生源，為學生解讀招生政策等；外聯崗的主要職責有：協助研究生院組織學生，與相關單位建立合作關系等；運營管理崗的主要職責有：做好學生入學、注冊、學費催繳工作，組織新學生的開學或開班典禮，整理并妥善保管相關合同、工作和費用記錄等。
教學教務與論文管理辦公室：負責MBA教學計劃的執行并管理與教學相關的各項活動，包含教學內務管理崗和學位論文管理崗。其中，教學內務管理崗的主要職責有：組織制定并執行MBA培養方案及各班級的教學計劃，為任課教師提供各種教學服務，建立MBA授課教師師資庫，收集、整理、保管各種教學文件和資料，監控教學質量，管理學生學分等；學位論文管理崗主要負責MBA畢業論文管理及學生畢業相關工作，主要職責有：指導學生論文的選題及論文寫作，組織學生與導師雙向選擇，組織學生的開題答辯、論文送審及答辯，組織學生畢業典禮及離校事宜，建立校外導師團隊，并負責關系的維護等。
學生工作與職業指導辦公室：負責MBA學生的日常管理、MBA聯合會日常事務以及職業指導工作，包含學生事務管理崗和職業發展規劃崗。其中，學生事務管理崗的主要職責有：協助招生主任完成學生入學、注冊工作，搜集整理MBA學生的相關信息及時反饋給各部門，指導MBA聯合會及各班級開展各項活動，落實MBA學生實踐培養環節，組織各年度的學生評優評獎工作等；職業發展規劃崗的主要職責有：定期更新MBA學生通訊錄、MBA校友通訊錄，分析在校生構成、畢業生發展動態，計劃MBA學生經費的使用，并把更新后的學生通訊錄及時上報數據庫等。
綜合服務辦公室：負責中心的財務記錄、日常行政工作管理及相關資料保存，包含財務崗、檔案管理崗和硬件維護崗。其中，財務崗的主要職責有：記錄及核算中心各項經費的使用情況，主持中心的各項日常行政工作，協調中心的各種接待工作等；檔案管理崗的主要職責有：組織起草中心各種文件，管理上級來文的批辦，保管中心印章并記錄印章的使用情況，綜合管理各種文件、資料、檔案等；硬件維護崗的主要職責有：建設并維護中心網站，維護辦公環境和安全等。

項目的管理流程
在項目管理流程方面，主要分為招生宣傳、教務教學、學位論文管理三大階段。在招生宣傳階段，基于人才培養需求分析，一方面進行招生宣傳及入學考試，另一方面研討并審核通過教學計劃和課程大綱；入學后，進入教務教學階段，包括學生職業生涯發展指導、組織與實施教學、教學評估等；教學周期結束后，由學位論文管理處負責學生畢業論文寫作、雙向選擇導師、論文審查、答辯等工作，學生工作處做好后期跟蹤調研。