上海海事大學物流工程學院由機械工程系、電氣自動化系、工業工程系、中荷機電工程學院(中荷機電工程系)、機械工程實驗中心和電氣自動化實驗中心組成。學院現有電氣工程1個博士后流動站，電氣工程1個一級學科博士點，機械工程、電氣工程和控制理論與控制工程3個一級學科碩士點，機械、能源動力和工程管理3個工程碩士專業學位點，以及機械設計制造及其自動化、機械電子工程、工業工程、物流工程、電氣工程及其自動化、自動化、測控技術與儀器、機械電子工程(中荷合作)和電氣工程與智能控制(中荷合作)等9個本科專業，可面向海外招收留學生。機械設計制造及其自動化為國家特色專業，港口機械電子工程是上海市重點學科，港航電力傳動與控制、電力電子與電力傳動、機械設計及理論學科是上海市教委重點學科，物流工程專業、機械設計制造及自動化專業、電氣工程及其自動化專業屬上海市高校教育高地重點建設項目。

　　學院現有教職員工150余名，專任教師110余名，其中正教授23名，副教授32名，博士生導師17名，碩士生導師77名，入選國家"青年千人"、上海市"領軍人才"、上海市"東方學者"、上海市"曙光學者"等、上海市"啟明星"、上海市"晨光學者"、上海市"揚帆計劃"等人才計劃27人次。近年來，學院承擔并完成國家重點研發計劃、國家863計劃、國家自然科學基金、教育部博士點基金、上海市自然基金等100余項科研項目，形成了一系列國家級和省部級科研成果，為工業界解決了許多應用難題，在相應的學科領域和工業界里享有良好的聲譽。學院與上海國際港務集團、振華重工集團、上汽集團、德國TUV、等許多國內外著名企業有著長期密切的產學研合作關系，與法國南特大學、法國海軍學院、波蘭格丁尼亞海事大學等有著廣泛的科研合作。

　　學院現已建成一批先進的科研平臺和高水平實驗室，包括教育部集裝箱供應鏈工程研究中心、上海市港航物流信息技術工程研究中心、電力傳動與控制研究所、機械工程設計研究所、港機與海洋工程裝備檢測中心(國家資質認證機構)、"上海海事大學-施耐德電氣聯合實驗室"、"波浪補償實驗室"、"大型散貨機械裝卸實驗室"、"海大-漢德港機和海洋工程裝備聯合實驗室"、海上清潔能源電力系統實驗室、港機與海工結構焊接實驗室等。學院還擁有"上海海事大學-上海汽車集團股份有限公司乘用車分公司"工程實踐教育中心和"上海海事大學-上海振華重工(集團)股份有限公司"工程實踐教育中心兩個國家級工程實踐中心，以及"現代港口物流"國家級虛擬仿真實驗中心和"現代港口物流"國家級實驗教學示范中心，這些國家級實踐平臺現已發展成為學生實踐和創新培養的核心支撐機構。在為工業界科技服務的過程中，學院也形成了一批面向工程應用的實踐基地，現有研究生實習實踐基地30個，其中國家級基地1個，校級基地3個，院級基地26個，為研究生實踐能力的培養提供了充分的保障。

　　學院秉承"格物致知，知行合一，自強不息，厚德載物"的教育理念，始終堅持港航和物流學科特色，面向長三角一體化、上海國際科創中心、上海國際航運中心和上海臨港國際制造中心等區域戰略發展目標，以工業4.0、智慧港口、物聯網等為應用背景，開展智能制造、物流裝備健康診斷、船舶電力推進等研究，著力提升我國港航物流裝備領域的研發能力和核心競爭力，力爭為國家大型港口、航運、物流企業提供人才支持和技術支撐，為海上絲綢之路保駕護航。